新品发布丨OMNIdrop SYSTEM 全能液滴微流控分析系统

达普生物ThunderBio

发布于:2024-05-22

摘要:

以下文章首发于:



近年来,高通量液滴微流控技术在药物发现、菌株筛选、单细胞组学、低丰度分子定量等领域展示了其巨大的应用潜力。然而,目前市面上的微流控系统存在功能单一,使用门槛高、集成度低等局限,限制了其在基础生命科学中的广泛使用。


为了解决上述问题,达普生物推出了创新性的多功能液滴微流控分析系统(OMNIdrop SYSTEM)。该系统整合了多种液滴操纵的技术,以满足多种基础生命科学的场景中利用微液滴技术进行方法学开发的需求。





01


高通量单细胞测序:


超高通量单细胞建库测序高通量单细胞转录组、免疫组库、表观组学测序文库构建,而后通过测序进行生信分析,用于发现疾病机制,找到治疗相关靶点。




相较于当前市面上的单细胞建库仪(单次可上样细胞量最多 2 万),达普生物 OMNIdrop SYSTEM 有以下优势:


① 可上机捕获更多细胞,单次实验能够上机数十万个细胞;
② 相当于传统单细胞建库仪的 5~10 个样本的上样量;
③ 可当流式细胞仪使用,靶向单细胞测序;
④ 兼容市面上各大品牌的单细胞建库试剂盒。


02


针对稀有特定细胞进行单细胞测序:


达普生物 OMNIdrop SYSTEM 生成数百万含有单细胞的液滴,通过表型分析和液滴分选技术靶向富集 T 细胞,然后进行单细胞分析,在单细胞水平上获取更多 TCR 序列信息,进一步研究特定细胞状态下的 TCR 库,能够提供更加全面的关于 T 细胞免疫反应的功能和生理信息。



靶向单细胞测序可以:


① 通过表型分析,有效地富集稀有细胞或者功能性细胞进行深度单细胞测序分析;
② 有效关联表型和基因型信号,有助于生物学意义的挖掘;
③ 在细胞互作、病毒感染机制、多组学分析等方面有广阔的应用前景。



03


可溶性蛋白单 B 抗体筛选——OVA 抗体筛选:


超高通量功能性细胞筛选:针对靶点开发的抗体药物进行高通量筛选,以帮助从大量单 B 细胞中筛选出极有价值的稀有生物突变或抗体分泌细胞,加速抗体药物开发,同时也可用于合成生物学关于底盘细胞的高通量筛选,加速酶定向进化。

 


从 OVA 免疫的小鼠脾脏分离出 CD138+ 浆 B 细胞,取 1.0x10⁶ 浆 B 细胞与包被抗原磁珠制备单细胞液滴,液滴检测阳性率约 1.1%,打印 3 个 96 孔板进行反转录扩增,获得 168 个配对 VH/VL,取 20 个 unique 序列进行表达验证,其中 12 个 ELISA 检测阳性,阳性率为 60% 。



04


微生物筛选——酯酶进化筛选结果:



OMNIdrop SYSTEM 能对 1‰ 阳性的酯酶库的阳性菌株进行高效富集,准确度高达 98% 以上,筛选后的菌活性良好,表达的酶能有效水解酯类物质。


TCR-T 筛选:



达普的 OMNIdrop SYSTEM 还能实现报告细胞体系的荧光激活液滴分选,在单细胞水平上实现基于肿瘤抗原特异性识别的功能性 TCRs 高通量筛选,可达到数百万液滴/小时;其克服了 TCR 识别肿瘤特异性抗原的功能与 TCR-pMHC 亲和之间的弱相关性及基于亲和方法筛选效率低的问题;与 scRNA-seq 结合,揭示了 TCR-pMHC 识别的分子机制,有助于促进科学和临床研究。



05


单分子定量——百万级液滴单分子检测


在单分子定量层面,精确定量核酸与蛋白分子,可用于伴随诊断、生物药质检、基因编辑效果质检等。



① 不同于常规数字 PCR, 单次反应检测微单元限制在万级;
② OMNIdrop SYSTEM 可将单次反应检测单元拓展到百万级,并可将阳性液滴选出进行下游测序分析;
③ 在痕量拷贝数检测、超低频突变检测方向更具优势;
④ 检测精密度和准确性更高,具有更高的动态检测范围。



06


单分子定量与靶向富集测序——ddPCR+sorting seq:



杂交捕获和基于 PCR 的靶标富集策略通常需要为每 1000bp 的序列设计一个探针或引物集来进行富集。


① 液滴扩增分选进行富集,只需一个 taqman 探针即可实现富含靶标的 200kb 区域内片段的富集;
② 测序结果显示:序列富集度比全基因组平均覆盖率高出 13.6 倍;5 个靶标每个覆盖率都增加 24~37 倍。



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